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珍珠粟细胞质-原性雄性不育系统中,GBS连接起来图谱确定了主要的QTL

2024-01-27   来源 : 电视

绘图分布区所示,以及绘图一个或多个主要Rf底物。

这些底物监管A中曾的男普遍性生孩子丧失和男普遍性生孩子可维持4琥珀粟CMS的另有统。

六、GBS和其他标明的现有突变速食著者的十分

生物医学DNA电子技术和运用于DNA归纳的用户友善型软件包的电子技术开发极大地改进标明物样品的必需。基于SNP的速食著者早就运用于许多蔬菜,特别是在那些有详见突变两组碱基的蔬菜中曾。

在琥珀粟层面,最近发布了两张基于GBS的一个大所示。Moumouni等人刊出了一张基于小F的经纬度。

很难运用于详见碱基,而Punnuri等人运用于基于分拆近交另有的算子社群,与我们研究工作中曾运用于的详见突变两组碱基草案相近。

Sehgal等人刊出了基于突变的SNP,CISP和EST-SSR的共识功能所示,其大小为815.3cM。然而,也有一些以在此之前的突变著者与我们的总著者大小类似或更为粗壮。

Qi等人刊出了一张基于F2琥珀粟分布区和242个SSR和RFLP标明,而郭等的重构琥珀粟著者极少跨越303cM。

速食所示的总大小受几个因素的阻碍,包括算子分布区的分拆数万人和子代的亲缘的关另有。因此,精确十分来自不尽相同研究工作的经纬度大小是很难意义的。

因为高约经纬度大小在相近的近似以外,就像我们的经纬度一样。我们的归纳和Punnuri等人都根据Rajaram等人的人口普查经纬度对LG同步进行了S。

然而,在我们的经纬度中曾,LG的比起大小与Punnuri等人份文件的大小有极大不尽相同。特别是LG3和LG6,它们在我们的经纬度中曾比起较粗壮,在Punnuri等人的经纬度中曾相当高约。

根据琥珀粟突变两组碱基中曾计算出来的碱基对,LG3是七个LG中曾最距离远的,LG6是大小的第4个。大小关联的一个意味著缘故意味著是为GBS必需的限制普遍性内切酶。

我们运用于酶Pstl,而Punnuri等人运用于ApeKIRajaram等人的共识所示中曾LG的比起大小比Punnuri等人经纬度上的LG比起大小更为相比之下我们经纬度的比起大小。

现有的两张基于GBS的客户端经纬度的标明能量密度都低于以在此之前基于其他标明类型的经纬度。经纬度辨识的能量密度低于我们的经纬度,而我们的经纬度又比Moumouni等人的经纬度能量密度更为高。

Punnuri等人份文件的能量密度更为高是意料之中曾的,因为他们运用于了RIL算子社群,该社群带有更为高的分拆数万人。

但是,我们基本上可以将经纬度分类为几乎比较大、均匀升高,因为邻接标明中间只有一个间隙超过10cM。

Ambawaat等人份文件的基于EST-SSR+DArT标明的复刻琥珀粟一个大所示跨越740cM,平均邻接标明距离为2.7cM。

运用于来自近交另有的140个个体的RIL分布区构筑的,预计这些近交另有不极少可以分离出来 d2 侏儒突变,还可以分离出来男普遍性生孩子丧失和男普遍性生孩子可维持1和A4琥珀粟的CMS的另有统。

将RIL社群次测试到等质子茎叶子代81A1和81A4将无需独立确认我们对A的结果4,以及确实这两个娱乐业电子技术开发的琥珀谷中CMS的另有统的分娩力丧失/生孩子可维持底物中间的的关另有。

Ambawat等人的著者在大多数速食两组的碱基外面范围中曾的优越突变两组覆盖数万人也借以标识为这两个CMS的另有统中曾的任何一个样品到的任何主要分娩丧失/无菌可维持底物的粘贴因子。

Ambawat等人确实了运用于PstI质子酸内切酶样品的突变标志物在必要标明物覆盖这些范围的有效普遍性。

当时他们只能绘图出以在此之前被确实“必算子”的防锈普遍性主要突变,因为它的一段距离比LG1上方的任何RFLP或SSR标明更为距离远。

七、男普遍性分娩力丧失的突变

在茎叶或果实构成政治经济获好评的蔬菜中曾,男普遍性生孩子的丧失在F中曾1混种可食用不一定是政治经济上行不通的混种可食用的必忽视先决状况。

混种可食用在发芽在此之前获好评,是混种可食用不须要要像怀雌香菇那样丧失雄普遍性生孩子的蔬菜的值得注意。

比方说,许多牧草和大多数观赏植物学不须要要丧失雄普遍性生孩子,因为它们在农业中曾运用于不须要要茎叶。

Gupta等暗示,男普遍性生孩子的丧失在4琥珀粟的CMS的另有统遵循单突变显普遍性突变模式,运用于类似于我们运用于的变异程序,我们的辨别结果与这一结果相反。

因为我们在F中曾还挖掘出了3:1的分离出来模式。2人口。然而,基于变异信息的单突变操控的假设无论如何还不明确,因为我们的算子研究工作结果暗示也意味著有次要突变。

以在此之前关于A的研究工作4琥珀粟中曾的CMS的另有统已确实其比较稳定的雄普遍性生孩子普遍性和有效率的雄普遍性生孩子丧失在巴基斯坦外面环境中曾。

基于A的许多茎叶子代对4CMS的另有统现已给予给中南美洲、纳米比亚以南南美以及南美的琥珀粟繁育者。

我们的变异信息暗示,这种比较稳定普遍性的极大一部分意味著是由于该的另有统中曾男普遍性生孩子可维持和男普遍性生孩子丧失的非常简单突变。

在这种情况下,人们可以前提地借此在喀麦隆外面环境中曾的生孩子和丧失带有类似的比较稳定普遍性。

七、雄普遍性分娩力丧失和株高QTL的解剖

基于SNP的突变速食著者运用于多元回归归纳,以明确雄普遍性分娩力恢株高复和的QTL。LG2上的一个标明间隔与雄花造成和自茎叶集突出关的。

对于雄花造成,QTL解读了辨别到的变异绝对值的14.5%,而它只解读了自茎叶集辨别到的变异绝对值的9.9%。

对于植物学倾斜度,在LG4上解剖出一个QTL,这解读了辨别到的变异绝对值的24.5%。QTL频数万人归纳暗示,在97%的交叉检验列车运行中曾挖掘出了雄花造成的QTL一段距离。

在38%的列车运行中曾样品到自生茎叶的QTL一段距离。在LG4上挖掘出了植物学倾斜度的QTL在69%的列车运行中曾。

我们运用于在R/qtl中曾实现的单标明回归静态检验了QTL归纳,以确认PLABMQTL中曾运用于的多元回归静态。两种算法都标识了相近一段距离的QTL,并且解读的变异绝对值比例十分类似。

八、揭示

琥珀粟是严寒潮湿外面环境中曾必忽视的谷中物和饲料蔬菜。通过混种繁育增加琥珀粟年产量的潜力极大。

细胞器雄普遍性生孩子和相应将的质子分娩力丧失/生孩子可维持突变是琥珀粟政治经济混种茎叶生产的必忽视用以。

绘图A的 Rf 突变4琥珀粟中曾的CMS的另有统将使显普遍性男普遍性分娩丧失等位突变及其隐普遍性男普遍性生孩子可维持对应将物更为发挥效用吸取。

这项研究工作的变异信息以及Gupta等人的变异信息暗示A的单突变突变4男普遍性生孩子丧失/男普遍性生孩子可维持。

这种突变在混种繁育中曾是须要要的,因为它比起更为容易吸取,并且不一定受外面环境阻碍很小。然而,我们绘图的QTL所解读的意想不到的较低绝对值暗示存在次要或粘贴突变。

在粗壮期内的研究工作运用于RIL年轻人,应将追查A的生孩子是否丧失4的另有统极少受一个主要突变,几个额外的次要突变或多个主要突变的阻碍,具体一般来说双亲的突变剧中。

所电子技术开发的KASP标明可运用于广泛应将用琥珀谷中混种繁育中曾所须要单倍块的生物医学挑选,从而推动琥珀谷中子混种子代的发育。

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